1，定義不同。自訴是被害人或者其法定代理人、近親屬直接向司法機關提起訴訟，追究被告人刑事責任，司法機關直接受理的刑事案件；公訴是人民檢察院針對犯罪嫌疑人的犯罪行為，向人民法院提出申訴，要求法院通過審判認定犯罪事實，對罪犯進行處罰的訴訟活動；
2.訴訟主體不同。自訴是當事人自己提起的訴訟，公訴是檢察院主動提起的訴訟；公訴是檢察院代表國家向法院提起的訴訟。
法律依據:《中華人民共和國刑事訴訟法》第212條。
人民法院對自訴案件可以進行調解；宣判前，自訴人可以與被告人和解，也可以撤回自訴。本法第二百壹十條第三項規定的案件，不適用調解。
人民法院審理自訴案件的期限，被告人被羈押的，適用本法第二百零八條第壹款、第二款的規定；未羈押的，應當在受理案件後六個月內判決。
提起自訴的程序是什麽？
1.準備相關材料。如鑒定材料、證據材料、自訴等。；
2.向人民法院提起自訴。自訴主體要符合法律；
3、人民法院經審查應當受理。不符合自訴條件的，人民法院應當依法駁回。人民法院有義務及時告知是否立案。