凱撒帶著軍團來到邊境的盧比孔河。根據羅馬法，任何指揮官都不能帶著部隊渡過盧比孔河，否則就是背叛羅馬。凱撒想了很久，有句名言“過河之後，將是人間悲劇；不渡河是我自己的毀滅。”於是他帶著軍團渡過盧比孔河。凱撒的行動震驚了龐貝，元老院和派系成員。他們沒想到凱撒這麽大膽，帶著自己的財物匆匆逃離了意大利半島。因此，愷撒沒有流血就進入了羅馬，並要求其余的元老院成員選舉他為獨裁者。
接著，他征服了西班牙和希臘，在公元前48年的薩盧斯戰役中徹底擊敗了龐貝，將龐貝追擊至埃及。為了取悅凱撒，埃及人要求他支持現任國王托勒密十三世。龐貝遇刺後，他們將龐貝的頭顱獻給了凱撒。然而，凱撒宣布埃及王位將由托勒密十三世和他的妹妹克利奧帕特拉分享。這激怒了埃及人，亞歷山大戰役爆發。愷撒第六軍與埃及軍隊鬥爭，隨著援軍的到來，徹底擊潰了埃及軍隊。托勒密十三世被殺，克利奧帕特拉·本·拉登登上埃及王位。遺憾的是，在戰鬥中，凱撒士兵發射的火箭彈擊中了亞歷山大的大圖書館，60多萬冊圖書被毀。亞歷山大戰役後，愷撒和克婁巴特拉進行了為期兩個月的尼羅河之旅，隨後征服了與羅馬毀約的首都王國。勝利後，他給元老院寫了壹封信，只有三個字，“維尼·VIDI·VICI”(我來了，我看到了，我征服了)。
前46年，愷撒回到羅馬後，再次召集軍隊進攻逃到北非並與努米底亞國王裘德結盟的龐貝殘余黨，在胡塔索斯之戰中取得了徹底的勝利。之後，凱撒回到羅馬，進行為期十天的凱旋。