風之杖講海拉爾被加農毀滅沈到海底,海拉爾王變成了龍舟(小誤),加農為統治世界要得到塞爾達公主的黃金三角,但此時公主壹已不存在了(不知是否以死),所以他開始地毯式搜索到處綁架尖耳朵的女孩,因此牽連到泰特拉(其實她擁有公主的血統)和林克的妹妹,林克救了泰特拉後為了救妹妹加入泰特拉成為海盜。在神殿泰特拉覺醒成為公主幫助林克,最終重新封印加農。
此後林克繼續同泰特拉旅行,在某海域泰特拉聽信了幽靈船的傳說想去拿寶藏結果被抓,林克在跳船時不幸落水漂流到某海島遇到精靈雪拉和西文爺爺,並在海王神殿結識船商萊茵巴克,西文教唆(==b)萊茵巴克同林克壹起尋找幽靈船就能拿到寶藏。當他們找到幽靈船後才發現泰特拉已被變成石頭,西文其實是海王大人。當年西文被怪物貝萊姆打敗,為逃跑和雪拉等精靈封印了自身的力量。西文幫林克鍛造了聖劍後同貝萊姆大戰3回合最終打敗了貝萊姆,泰特拉解除石化,西文也變回海王(其實就是只鯨魚==)。當林克與西文等人告別後卻發現自己和泰特拉躺在幽靈船的甲板上,而他們的船就在旁邊。其他海盜都不相信泰特拉所說的話,但林克卻看到萊茵巴克正在遠方的船上向林克招手……
又過了很多年,年老的尼克(泰特拉的壹位手下海盜)與壹位酷似林克的少年居住在鐵路發達的新海拉爾(在城堡劇情中可以看到天花板上有泰特拉的玻璃畫像,可以猜測靈魂軌跡的公主為泰特拉的後代。但林克貌似並不是沙漏時期林克的後代,否則尼克不會說“妳讓我想起我的那位摯友(老林克)”)此林克立誌成為火車司機,並前去城堡領取證書,認識了當代的公主和她身邊的可疑大臣。事後公主偷偷告訴林克她發現很多鐵軌開始消失,想背著大臣前去調查,結果發現大臣就是幕後黑手,他想通過讓鐵道消失來削弱靈魂之塔的力量,讓魔王(非加農)復活。大臣與手下鐵爪便當男打敗了林克(被秒殺==)和他的老師,將公主的靈魂與肉體強行分離,奪走肉體後和便當男消失。林克和公主的靈魂前去靈魂之塔調查,從先知處得知大臣想用公主的海拉爾之血增強魔王的力量(此處有公主發飆劇情,可見公主很好地繼承了泰特拉的禦姐之血……)。林克和公主開始勇闖世界各地的神殿修復靈魂軌跡(同時也修復被大臣打塌的靈魂之塔),最終林克和便當男(實為先知的弟子)決戰,便當男被打敗後在公主的感化下改邪為正,幫助公主奪回肉體結果被魔王滅口便當,公主的海拉爾之力覺醒與林克聯手打敗魔王(不愧是泰特拉的後代,不像其他作裏都是被宰的花瓶),兩人最後手拉手看夕陽……結局有三個,根據決戰前妳對公主的回答而定,我就 不壹壹細說了。
時之笛有漫畫版妳想要的話可以去百度貼吧塞爾達傳說吧(非廣告)
其他版本我基本沒怎麽玩(主要是玩不過去……)