001過山車謀殺案(讓工藤新壹變小)
128涉黑組織搶劫10億元(海巴拉艾姐姐之死)
129謀殺壹名涉黑組織女性和壹名大學教授(海原艾出現)。
176告別黑組織(灰色原創)
177告別黑組織(柯南)
告別178黑組織(解)
230個謎壹樣的乘客(上)(赤井秀壹出場，貝爾摩飾演新醫生拯救柯南，後面壹集有提到)
231謎壹樣的乘客(下)
告別309和黑暗組織(談判)
310與黑暗組織的告別(後續)
340個藏在廁所裏的秘密(上)(柯南幫海原愛拿到姐姐留下的錄音帶)
341藏在廁所裏的秘密(下)
345與黑暗集團戰鬥&月圓之夜的二元推理
425黑暗沖擊！當組織的爪子伸出的時候
柯南劇場版:天堂倒計時
出場次數:
230《神秘乘客(上)》
對應漫畫:V29F3-F5
播出時間:2006 54 38+0 4月16。
客戶回來後，杜松子酒和伏特加酒在爵士俱樂部裏秘密交談。貝爾摩偽裝成侍者出現了，貝爾摩看起來好像有了壞主意。
柯南等人因為去滑雪，上了這條線的車，阿沙拉也在其中。在去車站的路上，新醫生和朱迪上了公共汽車。這時，阿沙拉強烈地感受到了組織的氣息。
231“神秘乘客(下)”
對應漫畫:V29F3-F5
播出時間:2006年4月23日5438+0
柯南的巴士被壹幫強盜和罪犯劫持了。柯南推測後座的三個人中有劫匪的幫兇。劫匪B通過手機聯系，要求釋放主犯安島，大巴進入首都高速。碰巧看到窗外氣球的柯南，腦子裏閃過誰是強盜的同伴！
254 32/11-33/02本堂第四部罪犯愛情故事(下)2001-10-22三個碰巧遇到新老師的人繼續關註事態的發展。而日落前許下的誓言之吻，讓大家更加擔心。在柯南的幫助下，高木推理出了犯人。但是在追捕罪犯之後，日落的時候...
259 32/08-32/10來自芝加哥的男人(下)2001-11-26依靠尚未消失的血跡留下的線索和詹姆斯所持有的布美少年偵探隊徽章，柯南帶著追蹤眼鏡開始追。交通班的佐藤、高木和白緯玲壹起追捕罪犯。
286“紐約工藤新壹事件(Event)”
對應漫畫:V34F11-V35F4
播出時間:2002年7月15。
發高燒倒下的小蘭，在譫妄中想起了和新壹壹起去紐約。
欣宜和小蘭在欣宜的母親尤喜子去劇院的路上高速行駛，因超速被警察抓住。女演員莎倫·韋約德在紐約喬裝成警察救出了彥。
287“工藤新壹紐約事件(推論)”
對應漫畫:V34F11-V35F4
播出時間:2002年7月22日
新壹的母親廣子帶著15歲的小蘭和新壹在Sharon Wyjod的介紹下參觀了百老匯的幕後。小蘭救下差點被從天花板掉落的盔甲擊中的女演員羅斯。羅斯似乎害怕有人會殺了她。
舞臺劇開始後，以神話為主題的音樂劇達到了高潮。在舞臺中央扮演懸在空中的天使的演員休斯胸部中槍身亡。
288“紐約工藤新壹事件(解決方案)”
對應漫畫:V34F11-V35F4
播出時間:2002年7月29日
辛屹的母親——尤面前的和小蘭，15歲，音樂劇的男主角辛屹在舞臺上被殺。嫌疑人應該是同臺演出的四位女演員之壹。
新壹在舞臺裝置中發現羽毛後走向事件真相。廣子聽了新壹的推理後，開始在舞臺上上演推理秀，把犯人逼到了絕境。
335《杜東發展學院的秘密(上)》
對應漫畫:V41F4-F6
播出時間:2003年9月8日
簡介:由習字帶柯南壹行參觀杜東開發辦，是《蒙面超人》的試片。不過，聽說測試片是在半夜。因為和航班沖突，尤喜子離開柯南他們回去了。柯南，在穗島的職員公寓睡午覺，他們發生的地方。
336《杜東發展學院的秘密(下)》
對應漫畫:V41F4-F6
播出時間:2003年9月15。
作品簡介:柯南和家人因為推遲了看電影《蒙面超人》的時間，在沖洗照片的穗島公寓裏打了個盹。這時，正和他們壹起午睡的營銷古村被刺身亡。但是沒有人聽到犯人的腳步聲。由於發廊內壹片混亂，無法正常行走，而且燈也關了，現場壹片漆黑。根據現場情況，民警將穗島帶回派出所，但...
345《月圓之夜與黑組織面對面的雙重謎團》2小時特稿
對應漫畫:V42F5-F10
播出時間:2004年01.05
蘭收到了壹張萬聖節派對的邀請函，上面寫著有壹張謀殺通告。小五郎和紫苑去了聚會地點。另壹方面，心怡也收到了同樣的邀請函。而且新壹和柯南是同壹個人，逐漸暴露。柯南用麻醉槍讓他的悲傷入睡。在鬼船會場扮成亡靈船長的組織者，是壹場遊戲的開始。但是發生了組織者被殺的事件。與此同時，朱迪面前出現了被壹個人留在家裏的悲哀。
425 48/09-49/04黑組織魔爪伸出的瞬間(2小時特稿)2006-01-09小五郎在與播音員的壹次對話中得知她被惡作劇門鈴困擾，於是帶著柯南和蘭去了仁愛的家。雖然小五郎等人抓到了犯人，但此時柯南從安裝的bug中意識到，可惜奈其實是黑組織的黑幫成員。隨後，該黑組織制定了在edayP下午1暗殺壹名代號為DJ的男子的計劃。關註可憐奈的美國聯邦調查局經紀人朱迪決定與柯南聯手。為了阻止暗殺計劃，她需要知道ADP和DJ是什麽意思，然後開始推理。