在加拉巴哥群島考察時,達爾文發現每個島嶼上的陸龜及鷽鳥並沒有很大的差異,但又有些許的不同.他又發現加拉巴哥群島的生物與南美洲大陸的種類非常相似；於是他開始懷疑島上生物可能有***同的祖先,他們之間的差異是由於千百年來適應各個島嶼不同環境的結果.每壹個物種都是壹些細微的變化在無數個世代的過程中產生的結果.
生物進化在當時並不是新的概念.1809年時,法國動物學家拉馬克便提出：當環境改變時,物種會調適發展自己的器官來適應環境,常用的器官會發育變大、不用的器官會逐漸退化,並且這壹代獲取的改變會遺傳給下壹代；但沒有科學證據可以證明“用進廢退”和“獲得性特徵可遺傳”的假說.後來達爾文又從英國人口學者馬爾薩斯所著的《人口論》得到靈感；馬爾薩斯認為：人類糧食的生產永遠無法趕上人口的增加,致使糧食供不應求,進而發生饑荒或戰爭,導致壹部分人口死亡.達爾文以此聯想到生物演化發生的機制：演化是生存競爭中自由淘汰的結果,食物與空間等資源有限,只有最適應環境的個體才能生存下來,延續族群.
“天擇”的概念逐漸在達爾文的五年環球考察過程中形成.在1836年回到英國後,達爾文慢慢將他的看法寫成文章,然而沒有發表.大部分科學家認為,達爾文遲了很久才發表他的作品,原因之壹就是擔心自己的思想對於當時的社會來說過於激進.1858年,達爾文接到在馬來群島調查的博物學者華萊士有關物種形成的文章；華萊士對於物種形成的看法與他有很多相似之處,增加了達爾文對其學說的信心.於是兩人在1858年的倫敦皇家科學年會中,以兩人***同具名的方式,發表有關物種形成的看法.接著達爾文在1859年發表了《物種原始》.
達爾文的演化論當時引起了廣泛的爭議,被基督教會視為異端邪說,西方社會也對達爾文冷嘲熱諷.根據天主教當時的教條,人類是上帝依據自己形象所創造的最獨特、最完美的傑作.達爾文的理論不僅使得上帝創造萬物的說法被推翻,人類也被形容為千百年來殘酷的生存競爭所形成的產物,還指出人與其他哺乳動物有著***同祖先,這根本就是褻瀆上帝及基督教教義,這在當時保守的社會是相當大的震撼.
然而達爾文的理論在當時也並非完美無缺,當時尚未了解任何遺傳機制,無法解釋個體間的偶然差異是如何產生；直到後來與奧地利遺傳學家孟德爾的遺傳定律相結合,形成現在廣為大眾所接受的現代綜合理論.
1950年代後人類基因被發現,解開了演化論裏面物種內出現差異之謎和這些特徵如何通過繁殖遺傳後代.研究不同動物DNA,對比更加確認了***同祖先說.
看完以上文章,我們可以知道達爾文的理論觀點基本是從肉眼觀察和想象力建立起來的,基本用具只是紙和筆充其量加個放大鏡,在沒有高科技實驗室下,難免他的觀點會傾向主觀性,就好像人是猴子變的.
雖然有些人把進化論當笑話來看,不過無可否認進化論的確帶動了生物演變學的發展,笑的人也不見得放在那年代會做得更好,把妳赤裸放進森林也不見得妳比猴子聰明.許多現代科學如生物科學,遺傳傳學,甚至最先進的生物基因學的開山鼻祖.就好像我們不會知道未來人會否把現在的時間簡史,相對論當笑話來看,不過前車之鑒,後可借鏡；飲水思源,落葉歸根我們是不應該忘記的.