之所以會發生這樣的事情，主要和日本的天皇有關，因為在早期的時候，日本的天皇認為他們壹定要保證他們血脈的純正，因此在日本天皇眼中，他們皇室的血脈是不能夠隨便向外流傳的，這就造成了在皇室內部他們會選擇近親結婚。因為日本皇室不願意和平民結婚，因此就導致了他們在對自己配偶的選擇的時候，範圍是非常狹窄的，即使在偏遠那也是他們的遠方親戚，也是有壹定的血脈關系的。
我們以允恭天皇的兒子為例，當初允恭天皇的兒子就喜歡上他自己的親妹妹。而在允恭天皇退位以後，允恭天皇的兒子最終繼承了新的皇位。而在他繼承皇位後，就把他的妹妹封為了自己的皇後。而日本近親結婚的習俗也從這起事件以後開始流傳起來。因為人們看到他與他的妹妹兩個人，還有他的母親依然朝夕相伴，生活在壹起感到很幸福。這就感動了很多人，這才造成了眾多人紛紛模仿。
但是其實從現在的日本法律來看，日本的現代法律對於近親結婚是不被允許的。而對於那些親兄妹之間結婚是更不被允許的，在日本的法律當中要求四代以外的非直系親屬才可以結婚。當然到了現代，隨著科學層次的發展，人們已經認識到了近親結婚所造成的危害，因此也開始杜絕這壹現象。但是其實在早些時期，近親結婚並不止是在日本有所出現，在很多國家都是存在著這壹現象的。
像我國在古代也有近親結婚的現象。但是在我國古代近親結婚的現象並不嚴重，因為古代的時候儒家思想在中國的影響範圍很大，因此在儒家思想的影響之下，人們也認識到近親結婚是壹件十分可恥而且不被道德所允許的事情，因此在我國古代選擇近親結婚的人可以說是少之又少。