序 幕 懦弱的精靈
水果世界中，水果村民們因為七色彩蓮散發益果因子而健康成長，而七色彩蓮內存在著壹個精靈王國，精靈王子傑克具備掌管水果世界白天黑夜的神奇力量，因為有傑克和精靈們不斷提供光的能量，七色彩蓮得以健康生長；水果世界得以正常運轉。
老黴菌為了占領水果世界，建立自己的黴菌帝國，壹邊培育黴菌幼苗，壹邊偷偷的給七色彩蓮下毒。精靈王子“傑克”碰巧發現了老黴菌下毒，但因自己膽小，顧忌黴菌手上的針筒，不敢阻止，被精靈族人趕出精靈王國，外出流浪。
第壹幕 果寶擂臺賽
水果世界並不知道七色彩蓮發生的事情，瘋清揚帶著果寶特攻，東方求敗帶著四大惡賊為了爭奪女朋友，正在進行著“愛人爭奪戰”的擂臺比賽，比賽規則是失敗壹方將遭到封存武器，結果雙方打成平手，雙方武器都被收繳封存。沒有武器的瘋清揚和東方求敗覺得無聊，相繼離開了果凍學院和水果工廠出去雲遊，只留下橙留香、陸小果、菠蘿吹雪及四大惡賊。當他們發現七色彩蓮出了問題的時候，已經只剩下他們幾個去面對了。
第二幕 蓮花危機
果寶特攻與小精靈相遇，小精靈向果寶特攻們說明了自己的身世和使命。小精靈的出現讓橙留香、陸小果、菠蘿吹雪對這個外來物種好奇不已，特別是他變換白天黑夜的神奇力量，壹度把他當成電燈開關來使用。四大惡賊為了保住水果加工廠的生產產量，四下抓小精靈。
第三幕 笨賊出擊
四大惡賊得知小精靈和果寶特攻在壹起，為了盡快抓到小精靈，四大惡賊到臺下抓小朋友當手下，以便和果寶特攻對抗。但當得知小精靈的遭遇,而又背負***同的拯救水果世界的責任時，果寶特攻決定幫助小精靈成長。
第四幕 果寶課堂 為了解救七色彩蓮，果寶特攻決定培養小精靈，教他武功和知識，橙留香、陸小果、菠蘿吹雪三人分別給小精靈上了武術課、文化課、數學課。小精靈學習期間，四大惡賊頻頻出來搗亂，想抓小精靈；但終因配合不好，而又時運不濟，屢屢失手，鬧出不少笑話。另壹方面，大家也壹邊在調查黴菌老巢，想將其壹舉消滅，但始終找不到有效的線索。黴菌為了盡早達成自己的計劃，控制小精靈，讓水果世界沒有白天，只有黑夜，於是扮成醫生接近四大惡賊，用治好蓮花為條件跟四大惡賊換取小精靈，四大惡賊不知是計，果斷答應。
第五幕 山洞奇遇
學有所成的傑克精靈告別三位老師，獨自回去，在路上被四大惡賊劫走，陰差陽錯，五人壹起掉入黴菌的洞穴，黴菌兇相畢露，要全部殺害他們。危急之時，橙留香、陸小果、菠蘿吹雪帶著特制武器出現在他們面前。原來果寶和四大惡賊為了拯救他們***同的七色彩蓮，抵禦外來破壞者，早就暗裏結合尋找黴菌巢穴。這次四大惡賊和黴菌的交易早就是在果寶們的控制之內。狡猾的黴菌面對黴菌幼苗被毀滅，自己命運危在旦夕，用了壹招“看，有飛機”騙過了所有人，用針筒讓果寶和四大惡賊均中毒不能動。小精靈在最後關頭用所學功夫跟黴菌展開了決鬥，卻因經驗不足被黴菌打倒，在自己意誌的堅持和大家的鼓勵下，在山洞裏面散發出陽光的力量，終於打敗黴菌，救下大家！七色彩蓮因為沒有黴菌的侵害，在精靈們的幫助下，煥發出前所未有的活力，水果世界回到了之前的繁榮，壹切回歸正常。