出口貨物增值稅為零，即對應的銷項稅額為零。正因為銷項稅為零，進項稅才不能實際抵扣。所以不能抵扣的進項稅需要以退稅的形式實際抵扣。因此，出口退稅不是退還“銷項稅”，而是退還進項稅。
目前在實踐中，出口退稅並不是真正的零稅率，而是超低稅率，即稅率(17%，13%)與退稅率(不同貨物)之差，即稅法規定的出口退稅的計算比例。
根據企業會計制度的規定，實行“免、抵、退”辦法的生產企業的會計科目應增設以下增值稅欄目:
1，借方欄“國內產品出口抵扣應納稅額”
2、“出口退稅”貸方欄
此外，“轉出進項稅額”貸方欄核算“本期免退稅不得減免”，“應收補貼”科目核算“本期退稅”。
相關的會計處理是:
1，根據“本期免稅和抵扣不得免稅和抵扣”:
借方:主營業務成本
貸:應交稅費-應交增值稅(轉出的進項稅額)
2.根據“當期免稅額”:
借:應交稅金-應交增值稅(出口從國內產品的應納稅額中扣除)
貸款:應交稅費-應交增值稅(出口退稅)
3.顯示"當期退稅金額":
借:應收補貼
貸款:應交稅費-應交增值稅(出口退稅)
(這個分錄才是真正的退稅。根據“當期退稅額”的計算過程，可以知道期末未抵扣的剩余進項稅是退稅的。)
於是，“出口退稅”貸方欄占“當期免稅額”和“當期退稅額”之和，即為稅法規定的“當期免稅額和退稅額(=出口銷售額*退稅率)”。
對出口貨物實際執行的“超低稅率”計算的“銷項稅額”，計入“進項稅額轉出”貸方欄。如果把這個金額加到“出口退稅”的貸方欄，實際上就是內銷情況下應納的銷項稅額。
因此，“出口退稅”貸方欄反映的不是真實的退稅，而是出口貨物因稅率不同而比國內貨物少繳納的增值稅“銷項稅”。