正面觀點:CNV-seq可能更適合作為壹線產前診斷技術。
CNV-序列具有全基因組均勻覆蓋的優勢，可以檢測大於100Kb的CNV，而CMA由於探針覆蓋有限，可能檢測不到部分CNV。
CNV-seq具有高通量的優勢，壹次可以檢測80多個樣品。CMA是用於壹個樣本的芯片或用於6-8個樣本的芯片。
CNV-seq操作簡單，無PCR數據庫可以降低擴增偏好性，並且對樣本量要求低，低至10ng的所有DNA樣本都可以檢測。
CNV-seq在小規模嵌合體中具有更好的檢測效率，可以檢測到約10%的嵌合體，而CMA對於小於30%的嵌合體檢測不準確。
CNV-seq平臺兼容性好，可以和NIPT同時在電腦上使用。
CNV序列結合短串聯重復序列也檢測到非整倍體。
CNV-seq技術具有很強的擴展性，符合時代的發展。
對比觀點:現階段仍建議產前應用CMA。
技術創新是趨勢。我們不否認全基因組測序會極大的促進檢測技術的發展，發現更多的變異。但現階段，致病性CNV引起的微缺失和微復制基本可以被CMA檢測到，國內外權威機構都發布了CMA產前產後臨床應用指南，詳細闡述了CMA技術的應用細節。從整體效率來說，CMA並不輸給CNV-seq，所以目前CMA仍然是遺傳學產前診斷的優秀方法之壹。
CNV-seq臨床應用前仍有許多細節需要明確，大規模產前推廣仍需大樣本量的療效驗證。致病性小CNV的測序深度、PPV/NPV等壹些關鍵指標需要明確。
雖然CNV序列的檢測範圍擴大了，但也帶來了更多妳意想不到的發現。對於臨床醫生和家屬來說，提供太多超出目前醫學知識的變異，並不是壹件好事。
目前CMA仍是CNV檢測的金標準，其SNP探針不僅可以再次驗證CNV信號，還可以提供UPD/AOH信號，避免壹些重要疾病的漏檢。在有經驗的實驗室，通過SNP信號可以發現10%的嵌合體。
通過技術創新，如外顯子芯片的開發，CMA仍有很好的應用價值。
我們認為，在現階段，兩者在技術層面上的效率是差不多的。產前應用更要重視檢測結果的準確解讀和遺傳咨詢。
演講者1:
1.對於嵌合體，通過查閱我們中心的資料，發現CMA其實在各方面都優於CNV-seq，大於10%的嵌合體可以常規檢測。
2.CMA在檢測通量時不是問題。對於壹個月80例羊水的婦產門診來說，雖然壹個芯片壹次可以取8個樣本，但是可以同時做10個芯片。
3.在療效驗證方面，我院對羊水樣本的CMA和CNV-seq進行了平行比較。由於CMA采用了高密度SNP芯片，在100-400 K的情況下，檢測率優於大數據的0.25倍CNV-seq
4.我們相信我們所追求的是SNV+CNV能夠同時產生效果，即WES和CNV-seq的整合能夠用更少的錢獲得更高的收益，為患者改善更高的服務平臺。
5.單從技術上討論，兩者是對等的，但目前臨床檢測羊水CMA更穩定，CNV-seq可以做到，但我們並沒有停止CMA檢測，以防萬壹，畢竟是產前樣本，需要慎重。
演講者2:
1，檢測到的基因座越多越好。有些突變位點不明確，患者無臨床表型，外顯率低，給臨床醫生的遺傳咨詢帶來困難。
2.不是所有的突變都會導致非常不利的結果，也不是所有的孩子都適合WES或WGS。十多年的臨床經驗告訴我們，即使有致病變異，有針對性的臨床管理、生活質量和壽命的影響也是可控的。
3.單基因疾病有8000多種。目前認知有限，少見導致臨床經驗有限。基於人群的變異頻率可能差異較大，因此給患者進行遺傳咨詢是非常具有挑戰性的。
演講者3:
1，我們承認技術越新越好，老技術肯定會被淘汰。技術的使用是有針對性的。我認可CNV-seq的優勢，也承認UPD不如CMA，客觀上沒必要回避。
2.檢測到的信息越多，給家人的選擇就越多。前提是遺傳咨詢要專業，不是檢測什麽，而是專註於遺傳咨詢。
揚聲器4:
CNV-seq***先於美國發布，這可能是技術、數據和商業推動的結果。兩種技術是不同方法論的工具，使用哪壹種主要看如何選擇。從臨床的角度來說，如果要做產前診斷，檢查CNV、UPD、LOH，CMA被推薦；如果妳能忍受上述漏檢，妳可以選擇CNV序列。
評論:
關於CNV序列和CMA之間的比較的辯論是好的和必要的。CMA是壹個有十幾年臨床應用歷史的成熟平臺，但它是壹個“封閉”的平臺；CNV序列是壹種基於NGS的新興技術，它是壹個“開放”的平臺。可以想象，未來這項技術還會不斷完善。這場辯論旨在比較CNV-序列，壹個臨床CNV檢測項目，與臨床上常用的CMA平臺。任何觀點都是有時效性的，其真實含義需要通過表面現象來分析:
1.全基因組統壹覆蓋:
CNV-seq是基於第二代測序檢測CNV的技術，所以全基因組的均勻覆蓋是該技術平臺的特點，這對於SNV的檢測是壹個優勢，但這個特點不壹定是CNV檢測的優勢。我們知道基因組與疾病的關系是異質性的，基因組的壹些區域與遺傳疾病密切相關，壹些區域可以是已知的多態性。目前CMA芯片的設計刻意避開基因組中CNV的多態區、重復區和假基因區，但對於致病基因，尤其是經常以CNV為致病變異的基因，則刻意增加探針密度，以檢測更小的CNV。因此，CMA探針分布的異質性是優勢而非劣勢。相反，即使覆蓋CNV序列也能檢測出許多沒有臨床意義的CNVs，這增加了分析的負擔和假陽性的可能性。當然，假陽性的問題可以通過CNV濾波來控制。
2.探測靈敏度
用CMA檢測10kb甚至更小的CNV是可能的，可信的。目前CNV-seq的檢測靈敏度約為100K K，至於CNV的準確性，由於經驗數據的積累，CMA檢測到的大部分CNV我們不需要驗證，但目前我們對CNV-seq的可信度還不夠確定。此外，由於SNP探針，CMA可以檢測UPD、AOH和多倍體。目前CNV-seq還沒有能力檢測這些重要的變異，需要結合STR探針實驗來彌補。
3.操作通量
CNV-seq應該有更高的檢測通量，但目前CMA的通量可以達到200個樣本/人/周，而CNV-seq達不到這個通量，需要更多的人員投入，所以CNV-seq的高通量需要在實驗室的常規操作中實現。
4.嵌合體檢測
CMA和CNV-seq都可以檢測低比例嵌合體(如10%)。事實上，CMA可以檢測低級嵌合體，但壹般實驗室不會選擇報告低級嵌合體。
5.都是5。CNV seq和CMA正面臨著遺傳咨詢的挑戰。
目前無論采用哪種技術，技術的發展都是超越臨床醫學發展的。面對產前診斷檢測出的臨床意義不明的CNV和外顯率不明的CNV，無論使用哪種技術平臺，遺傳咨詢都很困難。
第二代測序技術(NGS)因其靈活性和高靈敏度將是未來CNV檢測的發展方向。考慮到覆蓋深度和成本的相關性，NGS研發的產品用於臨床產前診斷，替代CMA技術，需要對相關分析流程進行更多的驗證和改進，我們需要對全基因組產生的CNV有更全面的了解。
我是壹寧，從事互聯網和產前基因檢測多年。有興趣加入我們團隊的可以丟我:yining0010。