有機西紅柿在生產過程中不使用化肥、農藥、生長調節劑等化學物質，不使用基因工程技術，同時還必須經過獨立的有機食品認證機構全過程的質量控制和審查，允許使用有機肥料，主要用於基肥。不用化學農藥，而用防蟲網或生物農藥及其他非化學手段紡治病蟲害。
而無公害西紅柿是不用或少用化肥和化學農藥，其產品的殘留量經測定在國家規定的範圍內的稱綠色無公害西紅柿。
因此，有機西紅柿與無公害西紅柿有相同的地方，也有不同的地方。有機西紅柿也是無公害西紅柿，而無公害西紅柿就不壹定是有機西紅柿。
有了上面的認識，大家可能心裏有數了，真正的有機西紅柿國內比較少見，種植成本太高，消費者又缺乏信任，所以銷售環節太難。但是無公害西紅柿，作為種植戶來說還是容易做到，但就這是容易做到的事情，很多種植戶也不願意去做，因為信任缺失，好的東西未必賣的上好的價格，所以現在搞蔬菜種植的動輒賠錢很正常，菜販子們會壓得很低的價格收購，現在超市擺放的大部分蔬菜產品，能做到無公害的就算是有良心的。
大家有興趣可以去青青農客農場親自去種菜