1938年2月中旬到同年4月28日，長沙臨時大學從長沙搬遷到昆明。師生主要有三條路線遷入昆明。
長沙臨時大學師生步行遷滇香港越南路線
經廣州、香港乘船到越南海防市，再坐火車到昆明。走這條路線的重要教授有陳寅恪等。陳教授的妻子因為心臟病被留在香港由許地山照顧。大多數教師、家眷及部分女同學選擇了這條路線。
廣西越南路線
廣西政府曾經邀請長沙臨大師生遷移到桂林等地辦學。臨大常委采納了北大經濟系主任秦瓚教授的建議，決定仍然遷往更加安全的雲南。
為了向廣西政府解釋學校不遷移到廣西的原因，學校派遣陳岱孫教授去向廣西說明。同行的有朱自清、馮友蘭、錢穆、湯用彤、賀麟等十多人，由朱自清任團長。他們壹行從長沙乘坐汽車經過桂林、柳州到南寧，再經過鎮南關到越南河內，最後順滇越鐵路到達昆明。
經濟條件較好的男同學和少數女同學也選擇了這條道路。他們從長沙坐火車到桂林，再從桂林換乘汽車途經柳州、南寧到越南。最後也順滇越鐵路到達昆明。
湘黔滇旅行團
這是最艱苦的遷移路線。1938年2月19日師生開始遷移，***計336人。其中重要教授有聞壹多、黃鈺先、袁復禮、李繼侗、曾昭掄、吳征鎰等。師生徒步經過湖南湘西進入貴州，最後抵達雲南昆明。湘西的土匪眾多，路途不安全。張治中布置出生於湘西的作家沈從文先行與湘西各方勢力協商，最終土匪沒有為難師生。
4月28日，師生經過艱苦跋涉到達昆明。遷移全程約三千裏，可能為學生大規模遷徙路程之最。師生把這次遷移辦成教學任務，在途中對抗日救國進行積極宣傳，同時也不忘記在途中學習與實踐。